Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores. / de Rojas, Itziar; Moreno-Grau, Sonia; Tesi, Niccolo et al.
In: Nature Communications, Vol. 12, No. 1, 3417, 07.06.2021.

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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de Rojas, I, Moreno-Grau, S, Tesi, N, Grenier-Boley, B, Andrade, V, Jansen, IE, Pedersen, NL, Stringa, N, Zettergren, A, Hernández, I, Montrreal, L, Antúnez, C, Antonell, A, Tankard, RM, Bis, JC, Sims, R, Bellenguez, C, Quintela, I, González-Perez, A, Calero, M, Franco-Macías, E, Macías, J, Blesa, R, Cervera-Carles, L, Menéndez-González, M, Frank-García, A, Royo, JL, Moreno, F, Huerto Vilas, R, Baquero, M, Diez-Fairen, M, Lage, C, García-Madrona, S, García-González, P, Alarcón-Martín, E, Valero, S, Sotolongo-Grau, O, Ullgren, A, Naj, AC, Lemstra, AW, Benaque, A, Pérez-Cordón, A, Benussi, A, Rábano, A, Padovani, A, Squassina, A, de Mendonça, A, Arias Pastor, A, Kok, AAL, Meggy, A, Pastor, AB, Espinosa, A, Corma-Gómez, A, Martín Montes, A, Sanabria, Á, DeStefano, AL, Schneider, A, Haapasalo, A, Kinhult Ståhlbom, A, Tybjærg-Hansen, A, Hartmann, AM, Spottke, A, Corbatón-Anchuelo, A, Rongve, A, Borroni, B, Arosio, B, Nacmias, B, Nordestgaard, BG, Kunkle, BW, Charbonnier, C, Abdelnour, C, Masullo, C, Martínez Rodríguez, C, Muñoz-Fernandez, C, Dufouil, C, Graff, C, Ferreira, CB, Chillotti, C, Reynolds, CA, Fenoglio, C, Van Broeckhoven, C, Clark, C, Pisanu, C, Satizabal, CL, Holmes, C, Buiza-Rueda, D, Aarsland, D, Rujescu, D, Alcolea, D, Galimberti, D, Wallon, D, Seripa, D, Grünblatt, E, Dardiotis, E, Düzel, E, Scarpini, E, Conti, E, Rubino, E, Gelpi, E, Rodriguez-Rodriguez, E, Duron, E, Boerwinkle, E, Ferri, E, Tagliavini, F, Küçükali, F, Pasquier, F, Sanchez-Garcia, F, Mangialasche, F, Jessen, F, Nicolas, G, Selbæk, G, Ortega, G, Chêne, G, Hadjigeorgiou, G, Rossi, G, Spalletta, G, Giaccone, G, Grande, G, Binetti, G, Papenberg, G, Hampel, H, Bailly, H, Zetterberg, H, Soininen, H, Karlsson, IK, Alvarez, I, Appollonio, I, Giegling, I, Skoog, I, Saltvedt, I, Rainero, I, Rosas Allende, I, Hort, J, Diehl-Schmid, J, Van Dongen, J, Vidal, J-S, Lehtisalo, J, Wiltfang, J, Thomassen, JQ, Kornhuber, J, Haines, JL, Vogelgsang, J, Pineda, JA, Fortea, J, Popp, J, Deckert, J, Buerger, K, Morgan, K, Fließbach, K, Sleegers, K, Molina-Porcel, L, Kilander, L, Weinhold, L, Farrer, LA, Wang, L-S, Kleineidam, L, Farotti, L, Parnetti, L, Tremolizzo, L, Hausner, L, Benussi, L, Froelich, L, Ikram, MA, Deniz-Naranjo, MC, Tsolaki, M, Rosende-Roca, M, Löwenmark, M, Hulsman, M, Spallazzi, M, Pericak-Vance, MA, Esiri, M, Bernal Sánchez-Arjona, M, Dalmasso, MC, Martínez-Larrad, MT, Arcaro, M, Nöthen, MM, Fernández-Fuertes, M, Dichgans, M, Ingelsson, M, Herrmann, MJ, Scherer, M, Vyhnalek, M, Kosmidis, MH, Yannakoulia, M, Schmid, M, Ewers, M, Heneka, MT, Wagner, M, Scamosci, M, Kivipelto, M, Hiltunen, M, Zulaica, M, Alegret, M, Fornage, M, Roberto, N, van Schoor, NM, Seidu, NM, Banaj, N, Armstrong, NJ, Scarmeas, N, Scherbaum, N, Goldhardt, O, Hanon, O, Peters, O, Skrobot, OA, Quenez, O, Lerch, O, Bossù, P, Caffarra, P, Dionigi Rossi, P, Sakka, P, Hoffmann, P, Holmans, PA, Fischer, P, Riederer, P, Yang, Q, Marshall, R, Kalaria, RN, Mayeux, R, Vandenberghe, R, Cecchetti, R, Ghidoni, R, Frikke-Schmidt, R, Sorbi, S, Hägg, S, Engelborghs, S, Helisalmi, S, Botne Sando, S, Kern, S, Archetti, S, Boschi, S, Fostinelli, S, Gil, S, Mendoza, S, Mead, S, Ciccone, S, Djurovic, S, Heilmann-Heimbach, S, Riedel-Heller, S, Kuulasmaa, T, del Ser, T, Lebouvier, T, Polak, T, Ngandu, T, Grimmer, T, Bessi, V, Escott-Price, V, Giedraitis, V, Deramecourt, V, Maier, W, Jian, X, Pijnenburg, YAL, Smith, AD, Saenz, A, Bizzarro, A, Lauria, A, Vacca, A, Solomon, A, Anastasiou, A, Richardson, A, Boland, A, Koivisto, A, Daniele, A, Greco, A, Marianthi, A, McGuinness, B, Fin, B, Ferrari, C, Custodero, C, Ferrarese, C, Ingino, C, Mangone, C, Reyes Toso, C, Martínez, C, Cuesta, C, Muchnik, C, Joachim, C, Ortiz, C, Besse, C, Johansson, C, Zoia, CP, Laske, C, Anastasiou, C, Palacio, DL, Politis, DG, Janowitz, D, Craig, D, Mann, DM, Neary, D, Jürgen, D, Daian, D, Belezhanska, D, Kohler, E, Castaño, EM, Koutsouraki, E, Chipi, E, De Roeck, E, Costantini, E, Vardy, ERLC, contributors, EADB, MacLeod, C, Woods, B & Windle, G 2021, 'Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores', Nature Communications, vol. 12, no. 1, 3417. https://doi.org/10.1038/s41467-021-22491-8

APA

de Rojas, I., Moreno-Grau, S., Tesi, N., Grenier-Boley, B., Andrade, V., Jansen, I. E., Pedersen, N. L., Stringa, N., Zettergren, A., Hernández, I., Montrreal, L., Antúnez, C., Antonell, A., Tankard, R. M., Bis, J. C., Sims, R., Bellenguez, C., Quintela, I., González-Perez, A., ... Windle, G. (2021). Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores. Nature Communications, 12(1), Article 3417. https://doi.org/10.1038/s41467-021-22491-8

CBE

de Rojas I, Moreno-Grau S, Tesi N, Grenier-Boley B, Andrade V, Jansen IE, Pedersen NL, Stringa N, Zettergren A, Hernández I, et al. 2021. Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores. Nature Communications. 12(1):Article 3417. https://doi.org/10.1038/s41467-021-22491-8

MLA

VancouverVancouver

de Rojas I, Moreno-Grau S, Tesi N, Grenier-Boley B, Andrade V, Jansen IE et al. Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores. Nature Communications. 2021 Jun 7;12(1):3417. doi: 10.1038/s41467-021-22491-8

Author

de Rojas, Itziar ; Moreno-Grau, Sonia ; Tesi, Niccolo et al. / Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores. In: Nature Communications. 2021 ; Vol. 12, No. 1.

RIS

TY - JOUR

T1 - Common variants in Alzheimer’s disease and risk stratification by polygenic risk scores

AU - de Rojas, Itziar

AU - Moreno-Grau, Sonia

AU - Tesi, Niccolo

AU - Grenier-Boley, Benjamin

AU - Andrade, Victor

AU - Jansen, Iris E.

AU - Pedersen, Nancy L.

AU - Stringa, Najada

AU - Zettergren, Anna

AU - Hernández, Isabel

AU - Montrreal, Laura

AU - Antúnez, Carmen

AU - Antonell, Anna

AU - Tankard, Rick M.

AU - Bis, Joshua C.

AU - Sims, Rebecca

AU - Bellenguez, Céline

AU - Quintela, Inés

AU - González-Perez, Antonio

AU - Calero, Miguel

AU - Franco-Macías, Emilio

AU - Macías, Juan

AU - Blesa, Rafael

AU - Cervera-Carles, Laura

AU - Menéndez-González, Manuel

AU - Frank-García, Ana

AU - Royo, Jose Luís

AU - Moreno, Fermin

AU - Huerto Vilas, Raquel

AU - Baquero, Miquel

AU - Diez-Fairen, Mónica

AU - Lage, Carmen

AU - García-Madrona, Sebastián

AU - García-González, Pablo

AU - Alarcón-Martín, Emilio

AU - Valero, Sergi

AU - Sotolongo-Grau, Oscar

AU - Ullgren, Abbe

AU - Naj, Adam C.

AU - Lemstra, Afina W.

AU - Benaque, Alba

AU - Pérez-Cordón, Alba

AU - Benussi, Alberto

AU - Rábano, Alberto

AU - Padovani, Alessandro

AU - Squassina, Alessio

AU - de Mendonça, Alexandre

AU - Arias Pastor, Alfonso

AU - Kok, Almar A. L.

AU - Meggy, Alun

AU - Pastor, Ana Belén

AU - Espinosa, Ana

AU - Corma-Gómez, Anaïs

AU - Martín Montes, Angel

AU - Sanabria, Ángela

AU - DeStefano, Anita L.

AU - Schneider, Anja

AU - Haapasalo, Annakaisa

AU - Kinhult Ståhlbom, Anne

AU - Tybjærg-Hansen, Anne

AU - Hartmann, Annette M.

AU - Spottke, Annika

AU - Corbatón-Anchuelo, Arturo

AU - Rongve, Arvid

AU - Borroni, Barbara

AU - Arosio, Beatrice

AU - Nacmias, Benedetta

AU - Nordestgaard, Børge G.

AU - Kunkle, Brian W.

AU - Charbonnier, Camille

AU - Abdelnour, Carla

AU - Masullo, Carlo

AU - Martínez Rodríguez, Carmen

AU - Muñoz-Fernandez, Carmen

AU - Dufouil, Carole

AU - Graff, Caroline

AU - Ferreira, Catarina B.

AU - Chillotti, Caterina

AU - Reynolds, Chandra A.

AU - Fenoglio, Chiara

AU - Van Broeckhoven, Christine

AU - Clark, Christopher

AU - Pisanu, Claudia

AU - Satizabal, Claudia L.

AU - Holmes, Clive

AU - Buiza-Rueda, Dolores

AU - Aarsland, Dag

AU - Rujescu, Dan

AU - Alcolea, Daniel

AU - Galimberti, Daniela

AU - Wallon, David

AU - Seripa, Davide

AU - Grünblatt, Edna

AU - Dardiotis, Efthimios

AU - Düzel, Emrah

AU - Scarpini, Elio

AU - Conti, Elisa

AU - Rubino, Elisa

AU - Gelpi, Ellen

AU - Rodriguez-Rodriguez, Eloy

AU - Duron, Emmanuelle

AU - Boerwinkle, Eric

AU - Ferri, Evelyn

AU - Tagliavini, Fabrizio

AU - Küçükali, Fahri

AU - Pasquier, Florence

AU - Sanchez-Garcia, Florentino

AU - Mangialasche, Francesca

AU - Jessen, Frank

AU - Nicolas, Gaël

AU - Selbæk, Geir

AU - Ortega, Gemma

AU - Chêne, Geneviève

AU - Hadjigeorgiou, Georgios

AU - Rossi, Giacomina

AU - Spalletta, Gianfranco

AU - Giaccone, Giorgio

AU - Grande, Giulia

AU - Binetti, Giuliano

AU - Papenberg, Goran

AU - Hampel, Harald

AU - Bailly, Henri

AU - Zetterberg, Henrik

AU - Soininen, Hilkka

AU - Karlsson, Ida K.

AU - Alvarez, Ignacio

AU - Appollonio, Ildebrando

AU - Giegling, Ina

AU - Skoog, Ingmar

AU - Saltvedt, Ingvild

AU - Rainero, Innocenzo

AU - Rosas Allende, Irene

AU - Hort, Jakub

AU - Diehl-Schmid, Janine

AU - Van Dongen, Jasper

AU - Vidal, Jean-Sebastien

AU - Lehtisalo, Jenni

AU - Wiltfang, Jens

AU - Thomassen, Jesper Qvist

AU - Kornhuber, Johannes

AU - Haines, Jonathan L.

AU - Vogelgsang, Jonathan

AU - Pineda, Juan A.

AU - Fortea, Juan

AU - Popp, Julius

AU - Deckert, Jürgen

AU - Buerger, Katharina

AU - Morgan, Kevin

AU - Fließbach, Klaus

AU - Sleegers, Kristel

AU - Molina-Porcel, Laura

AU - Kilander, Lena

AU - Weinhold, Leonie

AU - Farrer, Lindsay A.

AU - Wang, Li-San

AU - Kleineidam, Luca

AU - Farotti, Lucia

AU - Parnetti, Lucilla

AU - Tremolizzo, Lucio

AU - Hausner, Lucrezia

AU - Benussi, Luisa

AU - Froelich, Lutz

AU - Ikram, M. Arfan

AU - Deniz-Naranjo, M. Candida

AU - Tsolaki, Magda

AU - Rosende-Roca, Maitée

AU - Löwenmark, Malin

AU - Hulsman, Marc

AU - Spallazzi, Marco

AU - Pericak-Vance, Margaret A.

AU - Esiri, Margaret

AU - Bernal Sánchez-Arjona, María

AU - Dalmasso, Maria Carolina

AU - Martínez-Larrad, María Teresa

AU - Arcaro, Marina

AU - Nöthen, Markus M.

AU - Fernández-Fuertes, Marta

AU - Dichgans, Martin

AU - Ingelsson, Martin

AU - Herrmann, Martin J.

AU - Scherer, Martin

AU - Vyhnalek, Martin

AU - Kosmidis, Mary H.

AU - Yannakoulia, Mary

AU - Schmid, Matthias

AU - Ewers, Michael

AU - Heneka, Michael T.

AU - Wagner, Michael

AU - Scamosci, Michela

AU - Kivipelto, Miia

AU - Hiltunen, Mikko

AU - Zulaica, Miren

AU - Alegret, Montserrat

AU - Fornage, Myriam

AU - Roberto, Natalia

AU - van Schoor, Natasja M.

AU - Seidu, Nazib M.

AU - Banaj, Nerisa

AU - Armstrong, Nicola J.

AU - Scarmeas, Nikolaos

AU - Scherbaum, Norbert

AU - Goldhardt, Oliver

AU - Hanon, Oliver

AU - Peters, Oliver

AU - Skrobot, Olivia Anna

AU - Quenez, Olivier

AU - Lerch, Ondrej

AU - Bossù, Paola

AU - Caffarra, Paolo

AU - Dionigi Rossi, Paolo

AU - Sakka, Paraskevi

AU - Hoffmann, Per

AU - Holmans, Peter A.

AU - Fischer, Peter

AU - Riederer, Peter

AU - Yang, Qiong

AU - Marshall, Rachel

AU - Kalaria, Rajesh N.

AU - Mayeux, Richard

AU - Vandenberghe, Rik

AU - Cecchetti, Roberta

AU - Ghidoni, Roberta

AU - Frikke-Schmidt, Ruth

AU - Sorbi, Sandro

AU - Hägg, Sara

AU - Engelborghs, Sebastiaan

AU - Helisalmi, Seppo

AU - Botne Sando, Sigrid

AU - Kern, Silke

AU - Archetti, Silvana

AU - Boschi, Silvia

AU - Fostinelli, Silvia

AU - Gil, Silvia

AU - Mendoza, Silvia

AU - Mead, Simon

AU - Ciccone, Simona

AU - Djurovic, Srdjan

AU - Heilmann-Heimbach, Stefanie

AU - Riedel-Heller, Steffi

AU - Kuulasmaa, Teemu

AU - del Ser, Teodoro

AU - Lebouvier, Thibaud

AU - Polak, Thomas

AU - Ngandu, Tiia

AU - Grimmer, Timo

AU - Bessi, Valentina

AU - Escott-Price, Valentina

AU - Giedraitis, Vilmantas

AU - Deramecourt, Vincent

AU - Maier, Wolfgang

AU - Jian, Xueqiu

AU - Pijnenburg, Yolande A. L.

AU - Smith, A. David

AU - Saenz, Aldo

AU - Bizzarro, Alessandra

AU - Lauria, Alessandra

AU - Vacca, Alessandro

AU - Solomon, Alina

AU - Anastasiou, Anna

AU - Richardson, Anna

AU - Boland, Anne

AU - Koivisto, Anne

AU - Daniele, Antonio

AU - Greco, Antonio

AU - Marianthi, Arnaoutoglou

AU - McGuinness, Bernadette

AU - Fin, Bertrand

AU - Ferrari, Camilla

AU - Custodero, Carlo

AU - Ferrarese, Carlo

AU - Ingino, Carlos

AU - Mangone, Carlos

AU - Reyes Toso, Carlos

AU - Martínez, Carmen

AU - Cuesta, Carolina

AU - Muchnik, Carolina

AU - Joachim, Catharine

AU - Ortiz, Cecilia

AU - Besse, Céline

AU - Johansson, Charlotte

AU - Zoia, Chiara Paola

AU - Laske, Christoph

AU - Anastasiou, Costas

AU - Palacio, Dana Lis

AU - Politis, Daniel G.

AU - Janowitz, Daniel

AU - Craig, David

AU - Mann, David M.

AU - Neary, David

AU - Jürgen, Deckert

AU - Daian, Delphine

AU - Belezhanska, Diyana

AU - Kohler, Eduardo

AU - Castaño, Eduardo M.

AU - Koutsouraki, Effrosyni

AU - Chipi, Elena

AU - De Roeck, Ellen

AU - Costantini, Emanuele

AU - Vardy, Emma R. L. C.

AU - contributors, EADB

AU - MacLeod, Catherine

AU - Woods, Bob

AU - Windle, Gill

PY - 2021/6/7

Y1 - 2021/6/7

N2 - Genetic discoveries of Alzheimer’s disease are the drivers of our understanding, and together with polygenetic risk stratification can contribute towards planning of feasible and efficient preventive and curative clinical trials. We first perform a large genetic association study by merging all available case-control datasets and by-proxy study results (discovery n = 409,435 and validation size n = 58,190). Here, we add six variants associated with Alzheimer’s disease risk (near APP, CHRNE, PRKD3/NDUFAF7, PLCG2 and two exonic variants in the SHARPIN gene). Assessment of the polygenic risk score and stratifying by APOE reveal a 4 to 5.5 years difference in median age at onset of Alzheimer’s disease patients in APOE ɛ4 carriers. Because of this study, the underlying mechanisms of APP can be studied to refine the amyloid cascade and the polygenic risk score provides a tool to select individuals at high risk of Alzheimer’s disease.

AB - Genetic discoveries of Alzheimer’s disease are the drivers of our understanding, and together with polygenetic risk stratification can contribute towards planning of feasible and efficient preventive and curative clinical trials. We first perform a large genetic association study by merging all available case-control datasets and by-proxy study results (discovery n = 409,435 and validation size n = 58,190). Here, we add six variants associated with Alzheimer’s disease risk (near APP, CHRNE, PRKD3/NDUFAF7, PLCG2 and two exonic variants in the SHARPIN gene). Assessment of the polygenic risk score and stratifying by APOE reveal a 4 to 5.5 years difference in median age at onset of Alzheimer’s disease patients in APOE ɛ4 carriers. Because of this study, the underlying mechanisms of APP can be studied to refine the amyloid cascade and the polygenic risk score provides a tool to select individuals at high risk of Alzheimer’s disease.

U2 - 10.1038/s41467-021-22491-8

DO - 10.1038/s41467-021-22491-8

M3 - Article

VL - 12

JO - Nature Communications

JF - Nature Communications

SN - 2041-1723

IS - 1

M1 - 3417

ER -